L' I.B.E., si basa sullo studio delle comunità di macroinvertebrati bentonici, quegli invertebrati cioè che abitualmente popolano un corso d'acqua e appartengono principalmente ai gruppi faunistici degli Insecta, Crustacea, Mollusca, Irudinea, Tricladida e Oligocheta.
Fra alcuni degli evidenti vantaggi dell'uso degli indicatori biologici di qualità si possono riassumere i seguenti:
permettono una valutazione nel tempo degli effetti prodotti dall'inquinamento su un corso d'acqua;
permettono di giungere a giudizi sintetici sulla qualità complessiva dell'ambiente, facilmente comprensibili anche ai "non addetti ai lavori";
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